Dovrai raccogliere gli indizi e ridurre il numero dei sospeti. Gli indizi vengono utilizzati nelle avventure della Campagna e si ottengono giocando alle avventure! Puoi scoprire gli indizi esplorando i livelli, risolvendo rompicapo (ad esempio, sbloccando un telefono o aprendo una cassaforte) e completando minigiochi, come ad esempio gli inseguimenti degli agenti della VILE.
Se sei negli ACME Files, puoi ottenere indizi parlando con i vari personaggi. Interroga tutte le persone che incontri per vedere se qualcuno ha informazioni per te. A volte, dovrai risolvere dei rompicapo per ottenere degli indizi.
Se hai già ridotto il numero dei sospetti, ma non hai ancora preso una decisione, puoi consultare i dossier dei tuoi sospetti e "confermare la ricognizione" per decidere se i loro alibi sono affidabili o sospettosi.