블랙 옵스는 특수정보부에서 시작할 수 있는 특별한 종류의 미션입니다. 블랙 옵스를 완료하면 블랙 옵스 미션에 할당된 사령관을 위한 경험치와 자원이 보상으로 제공됩니다. 방어 사령관(J. 트래셔)도 블랙 옵스에서 경험치를 받으니 유념하시기 바랍니다.